Βράζουμε τα ζυμαρικά σύμφωνα με τις οδηγίες τις συσκευασίας τους. Κρατάμε λίγο από το νερό που έβρασαν, τα σουρώνουμε, τα κρυώνουμε με άφθονο νερό, τα περιχύνουμε με λίγο ελαιόλαδο και τα κρατάμε στην άκρη. Ζεσταίνουμε σε ένα τηγάνι 5-6 κουτ. σούπας ελαιόλαδο, ρίχνουμε μέσα το κρεμμύδι, την κολοκύθα και σοτάρουμε σε μέτρια θερμοκρασία για 8-10 λεπτά, μέχρι να μαραθούν πολύ καλά.
Στη συνέχεια αλατοπιπερώνουμε, πασπαλίζουμε την καστανή ζάχαρη, ρίχνουμε το θυμάρι και συνεχίζουμε το σοτάρισμα για άλλα 3-4 λεπτά σε δυνατή φωτιά για να καραμελώσουν.
Σβήνουμε με λίγο από το νερό έβρασαν τα ζυμαρικά, προσθέτουμε το τυρί κρέμα και ανακατεύουμε μέχρι να λιώσει και να δέσει η σάλτσα. Ρίχνουμε τότε τα ζυμαρικά, τα φουντούκια και αν χρειάζεται λίγο ακόμα από το νερό που κρατήσαμε. Ανακατεύουμε πολύ καλά. Σερβίρουμε τα ζυμαρικά αμέσως, πασπαλισμένα με καπνιστό τυρί.