Ανακατεύουμε σε μπολ το αλέυρι με το αλάτι και τα αφήνουμε στην άκρη. Στο μίξερ χτυπάμε το βούτυρο μέχρι να ασπρίσει και προσθέτουμε το εκχύλισμα βανίλιας και αμυγδάλου. Ακολούθως την ζάχαρη. Συνεχίζουμε το χτύπημα και προσθέτουμε την Nutella, έπειτα τα αβγά και, αφού χαμηλώσουμε την ταχύτητα, προσθέτουμε το μισό αλεύρι και το γάλα. Έπειτα βάζουμε και το άλλο μισό αλεύρι και ανακατεύουμε με την σπάτουλα. Μοιράζουμε το μείγμα σε φορμάκια και ψήνουμε σε προθερμασμένο φούρνο στους 175 βαθμούς για 25 περίπου λεπτά.
Ετοιμάζουμε το γλάσο, βάζοντας σε μπέν μαρί τις σταγόνες σοκολάτας, το βούτυρο και τη βανίλια. Αφήνουμε να λιώσουν σε μέτρια φωτιά, ανακατεύουμε και περιχύνουμε τα cupcakes μας τα οποία αφήσαμε πρώτα να κρυώσουν.