Βάζουμε σε ένα μπολ τη σάλτσα πέστο και τα φιλέτα κοτόπουλου αφού πρώτα τα αλατοπιπερώσουμε ελαφρά. Γυρίζουμε από όλες τις πλευρές ώστε η σάλτσα να πάει παντού. Προθερμαίνουμε το φούρνο μας στους 200°C, βάζουμε σε ένα φαρδύ ταψί χαρτί ψησίματος και τοποθετούμε τα φιλέτα με τη σάλτσα και ψήνουμε περίπου μισή ώρα στους 180° C. Όταν είναι έτοιμο το κοτόπουλο, το βγάζουμε από το φούρνο, τοποθετούμε από πάνω τις λωρίδες ντομάτας και τη μοτσαρέλα και ξαναβάζουμε στο φούρνο για 5 λεπτά ακόμα ή μέχρι να λιώσει το τυράκι μας.